Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms