Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTP4A2Q12974 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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PTP4A2Q12974 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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