Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFRD2Q12894 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms