Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms