Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LOXL1Q08397 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms