Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEX3Q00994 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms