Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRF9Q00978 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms