Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms