Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCDC1P59894 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DCDC1P59894 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms