Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRCA2P51587 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRCA2P51587 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms