Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms