Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms