Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3CBP42338 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms