Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms