Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN7P35236 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms