Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCKBRP32239 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCKBRP32239 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCKBRP32239 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms