Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFNP31947 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFNP31947 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFNP31947 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms