Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKLRP30613 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKLRP30613 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
PKLRP30613 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKLRP30613 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKLRP30613 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms