Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CRABP1P29762 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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