Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ARID4AP29374 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARID4AP29374 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms