Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5F1P24539 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms