Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGS1P23219 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms