Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPN2P17655 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CAPN2P17655 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms