Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
IFITM1P13164 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms