Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK4P11802 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK4P11802 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms