Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTHFD1P11586 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms