Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHGAP10645 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHGAP10645 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms