Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms