Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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FAM58BPP0C7Q3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM58BPP0C7Q3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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