Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UBXN7O94888 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBXN7O94888 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms