Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SEC24DO94855 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC24DO94855 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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