Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SCN2BO60939 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCN2BO60939 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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