Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms