Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBXN8O00124 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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UBXN8O00124 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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UBXN8O00124 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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