Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD63C9JTQ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD63C9JTQ0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms