Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
A4D1N5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
A4D1N5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
A4D1N5 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
A4D1N5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms