Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SSPOA2VEC9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms