Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV6-7A0A0A0MS04 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV6-7A0A0A0MS04 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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