Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL27Q9Y4X3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL27Q9Y4X3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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