Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AFG3L2Q9Y4W6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms