Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms