Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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