Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTNNA3Q9UI47 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms