Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRBP1Q9P2E9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms