Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ROPN1BQ9BZX4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms