Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SMIM3Q9BZL3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SMIM3Q9BZL3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM3Q9BZL3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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