Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PUS3Q9BZE2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUS3Q9BZE2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms