Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms