Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
MAP1LC3CQ9BXW4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms