Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTKNQ9BST9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms